Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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C9orf172C9J069 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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C9orf172C9J069 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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C9orf172C9J069 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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C9orf172C9J069 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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C9orf172C9J069 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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C9orf172C9J069 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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C9orf172C9J069 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf172C9J069 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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C9orf172C9J069 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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