Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms