Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TARSL2A2RTX5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms