Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TSSC4Q9Y5U2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms