Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms