Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms