Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSEQ9UL01 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms