Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
XCL2Q9UBD3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms