Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCC13Q9NSE7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms