Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCAPERQ9BY12 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAPERQ9BY12 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms