Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms