Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms