Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms