Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC97Q96F63 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms