Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ULK4Q96C45 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms