Protein–RNA interactions for Protein: Q92952

KCNN1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN1Q92952 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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KCNN1Q92952 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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KCNN1Q92952 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN1Q92952 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN1Q92952 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN1Q92952 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN1Q92952 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNN1Q92952 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN1Q92952 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN1Q92952 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN1Q92952 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN1Q92952 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN1Q92952 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN1Q92952 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN1Q92952 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN1Q92952 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNN1Q92952 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNN1Q92952 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNN1Q92952 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNN1Q92952 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNN1Q92952 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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