Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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