Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDXQ7Z353 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms