Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms