Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FAM106A-201ENST00000392176 2281 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms