Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms