Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G6-203ENST00000402064 3011 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IL36RN-202ENST00000393200 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TIAM2-201ENST00000275246 2491 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SERPINE1-201ENST00000223095 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC010624.1-201ENST00000527209 1525 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF133-215ENST00000630056 1999 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms