Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms