Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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