Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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