Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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CTF1Q16619 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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CTF1Q16619 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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CTF1Q16619 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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CTF1Q16619 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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CTF1Q16619 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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CTF1Q16619 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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CTF1Q16619 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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CTF1Q16619 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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CTF1Q16619 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CTF1Q16619 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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