Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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PTCH1Q13635 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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