Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL355306.2-203ENST00000635102 1025 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 RPL6P24-201ENST00000445338 864 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC110760.2-202ENST00000507517 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ZNF546-204ENST00000596894 714 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC009275.1-202ENST00000609209 889 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PBLD-207ENST00000495025 1349 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LINC01715-202ENST00000427804 688 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC112907.1-201ENST00000434957 540 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms