Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CACNA1DQ01668 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CACNA1DQ01668 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms