Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms