Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MDM2Q00987 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MDM2Q00987 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms