Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX1P78337 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX1P78337 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX1P78337 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX1P78337 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX1P78337 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX1P78337 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX1P78337 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX1P78337 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX1P78337 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PITX1P78337 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX1P78337 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX1P78337 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX1P78337 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PITX1P78337 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX1P78337 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX1P78337 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX1P78337 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX1P78337 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX1P78337 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX1P78337 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PITX1P78337 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX1P78337 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX1P78337 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX1P78337 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PITX1P78337 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PITX1P78337 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PITX1P78337 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PITX1P78337 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX1P78337 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX1P78337 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms