Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LMO4P61968 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LMO4P61968 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LMO4P61968 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LMO4P61968 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms