Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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SPCS3P61009 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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SPCS3P61009 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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SPCS3P61009 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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SPCS3P61009 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SPCS3P61009 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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