Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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