Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBP50607 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBP50607 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBP50607 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms