Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MDH1P40925 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MDH1P40925 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MDH1P40925 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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