Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETFBP38117 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETFBP38117 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms