Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5C1P36542 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5C1P36542 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5C1P36542 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5C1P36542 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5C1P36542 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5C1P36542 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5C1P36542 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5C1P36542 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms