Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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