Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMA5P28066 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms