Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms