Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2A2P16615 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms