Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALB1P05937 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALB1P05937 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALB1P05937 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALB1P05937 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALB1P05937 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALB1P05937 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALB1P05937 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CALB1P05937 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALB1P05937 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms