Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DENRO43583 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DENRO43583 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DENRO43583 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DENRO43583 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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