Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms