Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC4A6NH21 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms