Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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