Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK1Q9UPV9 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms