Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLIP2Q9UDT6 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms